La citta passo dopo nelle mani dei Chola, dei Pandya, degli invasori musulmani come Malik Kafur, un generale d’Ala Ud-Din-Khalji che saccheggiarono la citta nel 1311, dai re indu Vijayanagar e dei Nanak che la governarono fino a 1781.

Un po piu tardi nel tempo, i Nanak del Karnataka conquistarono Madurai prima che passasse sotto il controllo della Compagnia Britannica delle Indie Orientali dove distrussero le fortificazioni che la circondavano. Quattro larghe arterie chiamate "veli” furono allora tracciate su queste vestiggini e delimitano oggi la vecchia citta.

Durante il regno di Ijayanagar, il dirigente popolare Timuralai Nayaka decoro la citta di monumenti e strutture splendide come il “raja gorupam” (torre principale) del famoso tempio di Minaksi situato nel  cuore della citta e che attira turisti e pellegrini. Questo tempio offre un eccellente esempio della archittettura dradiviana molto esuberante. L’insieme sacrato si estende su una superficie di 6 ettari e conta oggi 12 torri, alte di 45 di 50 metri, scolpite di rappresentazioni di animali o di personaggi celesti.

Questo dirigente ha anche eretto nel 1636 il palazzo di Nayaka che porta il suo nome, e un altro elemento importante della citta che sara restaurato nel 1870. La vita di Madurai e sempre agrementata di feste. L’evento piu importante rimane la festa di Chithrai che si svolge fra aprile e maggio e fa onore al matrimonio di Meenashi e di Sundareshwara (o Shiva). Le effigi di queste divinita sono colorate per questa occasione e la usanza fa che e portata attorno un tempio su un immenso carro.